鄭成功治理台灣期間，阿猴社一帶是屬於萬年縣管轄，後來又改為隸屬萬年州，當時鄭成功曾派兵開墾到瑯嶠（今恆春）一帶，並將這些區域分為八個平地社和山地社，這些區域包括了今日的里港、屏東市、萬丹、新園、林邊、乃至車城、恆春一帶，都在今日屏東縣內。
清治康熙年間才將阿猴城改為隸屬於鳳山縣管轄，同治年間，因為牡丹社事件，日本派兵侵台，清政府才重視台灣的海防事務，派沈葆楨到瑯嶠設海防，隔年在台灣最南端設立恆春縣，將率芒溪（今春日）以南規劃恆春縣，這個時期等於將屏東分割成二部分，率芒溪以北屬於鳳山縣，以南屬於恆春縣。日本領有台灣以後，改隸屬台南縣，本縣則分別屬於鳳山和恆春兩支廳，1896年改為鳳山縣，1898年又歸屬台南縣，1901年，改為阿猴及恆春兩廳，1909年合併為阿猴廳，到這時期本縣才算復合完整。1920年，改隸屬高雄州，1933年除了四郡以外，將屏東街改為屏東市，戰後，屏東市升為縣轄市，一直到1950年，因為實施地方自治，而改為屏東縣。目前，屏東縣計有一個縣轄市、三個鎮，及二十九個鄉。
